前五期的肿瘤可进化分析都是基于组织或血液检出的SNV和CNV，而这几年兴起的单细胞，越来越展露头角，自然，单细胞克隆进化也是目前的热点系列，接下来我们将介绍几款分析单细胞克隆进化的软件，也可以说是单细胞克隆进化的pepiline之一，即：
Canopy+Cardelino+RobustClone
Canopy：通过NGS测序评估肿瘤内异质性和追踪纵向和空间克隆进化历史。
癌症是一种由体细胞遗传和表观遗传改变的进化选择驱动的疾病。在这里，我们提出Canopy，这是一种通过一个或多个来自单个患者的样本的somaticvariants和表观变异来推断肿瘤进化系统发育的方法。该软件应用于纵向和空间实验设计的批量测序数据集，以及来自人类癌细胞MDA-MB-的可移植转移模型。Canopy成功地识别了细胞种群，并推断出与现有知识和地面真相一致的系统发育。通过数值模拟研究，探讨了关键参数对反卷积精度的影响，并与现有方法进行了比较。
Canopy是一个开源的R包，