DeepVariant安装
官方首推用docker装，没有root权限装个锤子；然后是从源码装，源码是基于Ubuntu的，我用的是CentOS；实在不行就用二进制文件装，我菜，我不会。
最后发现可以用conda装。
然后经历了一个晚上，一个上午，以及一个中午的自闭后，通过换环境、换源、换版本。。。等各种骚操作，最后在晚饭前终于成功了。
另外，装好后我一直用官方写的run_deepvariant来测试，一直找不到命令，以为没装上，就又用conda装了一遍，显示已经装好。。。。再次自闭。（期间还请教了同学，说用docker装成功了，但我没root权限，docker也不会）
后来去github上，找到了同样问题的人。
原来deepvariant的docker版本和conda版本命令不一样。。。。我自闭了！！！
所以接下来说一说怎么用conda装deepvariant
首先用conda搜一下有哪些版本的deepvariant以及需要的python版本
1$condasearchdeepvariant2Loadingchannels:done3#NameVersionBuildChannel4deepvariant0.4.1nppy27_0anaconda/cloud/bioconda5deepvariant0.4.1nppy27_1anaconda/cloud/bioconda6deepvariant0.6.0py27_0anaconda/cloud/bioconda7deepvariant0.6.1py27_0anaconda/cloud/bioconda8deepvariant0.6.1py27h5df_2anaconda/cloud/bioconda9deepvariant0.6.1py27h5df_3anaconda/cloud/bioconda10deepvariant0.7.0py27h5df_0anaconda/cloud/bioconda11deepvariant0.7.1py27h5df_0anaconda/cloud/bioconda12deepvariant0.7.2py27h5df_0anaconda/cloud/bioconda13deepvariant0.7.2py27h5df_1anaconda/cloud/bioconda14deepvariant0.8.0py27hd49_0anaconda/cloud/bioconda15deepvariant0.9.0py27hd49_0anaconda/cloud/bioconda16deepvariant0.10.0py27hd49_0anaconda/cloud/bioconda17deepvariant0.10.0py36hd49_1anaconda/cloud/bioconda18deepvariant0.10.0py36hd49_2anaconda/cloud/bioconda19deepvariant0.10.0py36hd49_3anaconda/cloud/bioconda20deepvariant0.10.0py36hf5ab_4anaconda/cloud/bioconda21deepvariant1.0.0py36hf3e76ba_1anaconda/cloud/bioconda22deepvariant1.0.0py36hf3e76ba_2anaconda/cloud/bioconda23deepvariant1.0.0py36hf3e76ba_3anaconda/cloud/bioconda24deepvariant1.0.0py36hf5ab_0anaconda/cloud/bioconda25deepvariant1.1.0py36hf3e76ba_0anaconda/cloud/bioconda26deepvariant1.1.0py36hf3e76ba_1anaconda/cloud/bioconda27deepvariant1.1.0py36hf3e76ba_2anaconda/cloud/bioconda28deepvariant1.2.0py36hf3e76ba_0anaconda/cloud/bioconda29deepvariant1.3.0py36hf3e76ba_0anaconda/cloud/bioconda
我决定装最新的1.3.0，需要python3.6。
所以新建一个python3.6的环境
1pythoncreate-namepy3.6python=3.6
PS：我在新建环境时也遇到了bug，一直显示无法找到python3.6的包，最后是换源才解决的，来看一下我现在用的源
1$cat~/.condarc2ssl_verify:true34channels:5-