白癜风慈善爱心月 http://m.39.net/pf/a_5972921.htmlSparCC的微生物网络构建示例续前文“微生物共发生网络”，本篇继续简介SparCC的网络构建方法。基于高通量测序的技术，例如16SrRNA分析，为阐明天然微生物群落的复杂结构提供了便利。对于识别群落中微生物相互作用，基于物种丰度组成数据的相关性分析是一种常见方法，但是这种分析可能会产生与真实情况相违背的虚假关系，归因于测序获得的物种丰度或基因丰度等很难绝对定量。群落多样性是调节这种组合效应的剧烈程度的关键因素，为此SparCC方法被开发出来，它能够根据成分数据估算相关值（FriedmanandAlm,）。已经表明，SparCC是一种适合测序数据特征的新颖方法，可以推断物种或基因之间的相关性，以及构建微生物物种或基因功能相互作用网络。接下来展示SparCC工具计算相关性的方法，并通过相关矩阵构建关联网络。
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