纯净水和蒸馏水的主要区别在于概念、制的方法和成分上：
1.概念：纯净水是指不含杂质或细菌的水，而蒸馏水是指经过蒸馏、冷凝操作的水。
2.制的方法：纯净水可以通过电渗析器法、离子交换器法、反渗透法、蒸馏法及其他适当的加工方法制得；而蒸馏水是通过蒸馏法以及配合一定的措施制得。
3.成分：纯净水中不含无机盐等等，而蒸馏水中会含有部分无机盐和有机物。
此外，纯净水和蒸馏水的用处也不同，纯净水常用于日常生活用水及普通的工业生产用水，而蒸馏水常用于化工、医药、电子等要求较高的精密生产中。两者的设备配置也有所不同，纯净水设备的一般配置是单极反渗透或双极反渗透，而蒸馏水的配置，处理专用的蒸发设备外，目前市面上常用的是双击反渗透+EDI模块，或者是双极反渗透+混床离子交换柱。
